Confrontation entre modèles et données réelles pour la structure spatiale des molécules d'ADN par le biais de la réalité augmentée - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2006

Confrontation entre modèles et données réelles pour la structure spatiale des molécules d'ADN par le biais de la réalité augmentée

Résumé

Si les séquences génomiques sont d'abord connues sous leur forme linéaire, elles ont aussi une structure tridimensionnelle potentiellement utilisable pour l'analyse des génomes. Cette représentation de la structure 3D apporte un point de vue nouveau pour l'analyse des séquences. Les propriétés géométriques de l'ADN sont très peu étudiées, en particulier pour de grands segments d'ADN. C'est justement sur ce dernier verrou que la synergie entre informaticiens et biologistes peut en exploitant la pluridisciplinarité être extrêmement fructueuse. Un logiciel complet, ADN-Viewer, a été développé pour aborder la modélisation 3D de l'ADN. Il est basé sur un modèle de conformation local. Notre objectif est de confronter les résultats prédits par ce logiciel avec des données (images) réelles issues d'expérimentations biologiques. Il s'agit donc d'essayer d'affiner le modèle 3D par appariement d'images réelles et prédites. L'analyse des molécules en microscopie de force atomique (AFM) nous permettra de faire une analyse structurale de différentes régions intéressantes du génome. Ces images seront comparées, appariées et recalées avec les images prédites avec des techniques d'analyse et de traitement d'images. Il serait pertinent de quantifier l'erreur de prédiction et de corriger, par retour vers le modèle, les règles de conformation tri-dimensionnelle.
Fichier principal
Vignette du fichier
Essabbah06c.pdf (233.59 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Loading...

Dates et versions

hal-00633202 , version 1 (17-10-2011)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00633202 , version 1

Citer

Mouna Essabbah, Rachid Gherbi, Malik Mallem. Confrontation entre modèles et données réelles pour la structure spatiale des molécules d'ADN par le biais de la réalité augmentée. 3e Workshop Applications Médicales de l'Informatique : Nouvelles Approches (AMINA 2006), Nov 2006, Monastir, Tunisie. pp.n.a. ⟨hal-00633202⟩
157 Consultations
90 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More