DNA barcoding and molecular systematics of the benthic and demersal organisms of the CEAMARC survey. - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Polar Science Année : 2011

DNA barcoding and molecular systematics of the benthic and demersal organisms of the CEAMARC survey.

Agnès Dettaï (1) , Sarah J. Adamowizc (2) , Louise Allcock (3, 4) , Claudia P. Arango (5) , David K.A. Barnes (6) , Iain Barratt (4) , Anne Chenuil (7) , Arnaud Couloux (8) , Corinne Cruaud (8) , Bruno David (9) , Françoise Denis (10) , Gaël Denys (11) , Angie Díaz (12) , Marc Eléaume (13) , Jean-Pierre Féral (7) , Aurélie Froger (13) , Cyril Gallut (1) , Rachel Grant (14) , Huw J. Griffiths (6) , Christoph Held (15) , Lenaïg G. Hemery (11) , Graham Hosie (16) , Piotr Kuklinski (17, 18) , Guillaume Lecointre (1) , Katrin Linse (6) , Pierre Lozouet (1) , Christopher Mah (19) , Françoise Monniot (11) , Mark D. Norman (20) , Timothy O'Hara (20) , Catherine Ozouf-Costaz (1) , Claire Piedallu , Benjamin Pierrat (9) , Elie Poulin (12) , Nicolas Puillandre (1) , Martin Riddle (16) , Sarah Samadi (1) , Thomas Saucède (9) , Christoph Schubart (21) , Peter J. Smith (22) , Darren W. Stevens (22) , Dirk Steinke (2) , Jan M. Strugnell (23) , Katarzyna Tarnowska (7) , Victoria Wadley (16) , Nadia Améziane (13)
1 SAE - Systématique, adaptation, évolution
2 Canadian Centre for DNA Barcoding
3 Martin Ryan Marine Science Institute
4 School of Biological Sciences
5 Natural Environments Program
6 BAS - British Antarctic Survey
7 DIMAR - Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine
8 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
9 Biogéosciences [UMR 5561] [Dijon]
10 MMS - Mer, molécules et santé EA 2160
11 BOREA - Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques
12 Instituto de Ecología y Biodiversidad
13 BOME - Biologie des organismes marins et écosystèmes
14 Scott Polar Research Institute
15 Functional Ecology
16 AAD - Australian Antarctic Division
17 NHM - The Natural History Museum [London]
18 Institute of Oceanology
19 Department of Invertebrate Zoology
20 Museum Victoria
21 Biologie 1
22 NIWA - National Institute of Water and Atmospheric Research [Wellington]
23 Department of Zoology
Agnès Dettaï
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Systématique, adaptation, évolution
CV
Sarah J. Adamowizc
  • Fonction : Auteur
Canadian Centre for DNA Barcoding
Louise Allcock
  • Fonction : Auteur
Martin Ryan Marine Science Institute
School of Biological Sciences
Claudia P. Arango
  • Fonction : Auteur
Natural Environments Program
David K.A. Barnes
  • Fonction : Auteur
British Antarctic Survey
Iain Barratt
  • Fonction : Auteur
School of Biological Sciences
Anne Chenuil
Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine
CV
Arnaud Couloux
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 908635
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
Corinne Cruaud
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
Bruno David
  • Fonction : Auteur
Biogéosciences [UMR 5561] [Dijon]
Françoise Denis
Mer, molécules et santé EA 2160
Gaël Denys
Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques
CV
Angie Díaz
  • Fonction : Auteur
Instituto de Ecología y Biodiversidad
Marc Eléaume
Biologie des organismes marins et écosystèmes
CV
Jean-Pierre Féral
Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine
CV
Aurélie Froger
  • Fonction : Auteur
Biologie des organismes marins et écosystèmes
Cyril Gallut
Systématique, adaptation, évolution
CV
Rachel Grant
  • Fonction : Auteur
Scott Polar Research Institute
Huw J. Griffiths
  • Fonction : Auteur
British Antarctic Survey
Christoph Held
  • Fonction : Auteur
Functional Ecology
Lenaïg G. Hemery
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1084410
Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques
Graham Hosie
  • Fonction : Auteur
Australian Antarctic Division
Piotr Kuklinski
The Natural History Museum [London]
Institute of Oceanology
Guillaume Lecointre
Systématique, adaptation, évolution
Katrin Linse
  • Fonction : Auteur
British Antarctic Survey
Pierre Lozouet
  • Fonction : Auteur
Systématique, adaptation, évolution
Christopher Mah
  • Fonction : Auteur
Department of Invertebrate Zoology
Françoise Monniot
  • Fonction : Auteur
Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques
Mark D. Norman
  • Fonction : Auteur
Museum Victoria
Timothy O'Hara
  • Fonction : Auteur
Museum Victoria
Catherine Ozouf-Costaz
  • Fonction : Auteur
Systématique, adaptation, évolution
Claire Piedallu
  • Fonction : Auteur
Benjamin Pierrat
  • Fonction : Auteur
Biogéosciences [UMR 5561] [Dijon]
Elie Poulin
Instituto de Ecología y Biodiversidad
Nicolas Puillandre
Systématique, adaptation, évolution
Martin Riddle
  • Fonction : Auteur
Australian Antarctic Division
Sarah Samadi
Systématique, adaptation, évolution
CV
Thomas Saucède
Biogéosciences [UMR 5561] [Dijon]
Christoph Schubart
  • Fonction : Auteur
Biologie 1
Peter J. Smith
  • Fonction : Auteur
National Institute of Water and Atmospheric Research [Wellington]
Darren W. Stevens
  • Fonction : Auteur
National Institute of Water and Atmospheric Research [Wellington]
Dirk Steinke
  • Fonction : Auteur
Canadian Centre for DNA Barcoding
Jan M. Strugnell
  • Fonction : Auteur
Department of Zoology
Katarzyna Tarnowska
  • Fonction : Auteur
Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine
Victoria Wadley
  • Fonction : Auteur
Australian Antarctic Division
Nadia Améziane
Biologie des organismes marins et écosystèmes

Résumé

The Dumont d'Urville Sea (East Antarctic region) has been less investigated for DNA barcoding and molecular taxonomy than other parts of the Southern Ocean, such as the Ross Sea and the Antarctic Peninsula. The Collaborative East Antarctic MARine Census (CEAMARC) took place in this area during the austral summer of 2007e2008. The Australian vessel RSVAurora Australis collected very diverse samples of demersal and benthic organisms. The specimens were sorted centrally, and then distributed to taxonomic experts for molecular and morphological taxonomy and identification, especially barcoding. The COI sequences generated from CEAMARC material provide a sizeable proportion of the Census of Antarctic Marine Life barcodes although the studies are still ongoing, and represent the only source of sequences for a number of species. Barcoding appears to be a valuable method for identification within most groups, despite low divergences and haplotype sharing in a few species, and it is also useful as a preliminary taxonomic exploration method. Several new species are being described. CEAMARC samples have already provided new material for phylogeographic and phylogenetic studies in cephalopods, pycnogonids, teleost fish, crinoids and sea urchins, helping these studies to provide a better insight in the patterns of evolution in the Southern Ocean.

Domaines

Génétique des populations [q-bio.PE] Systématique, phylogénie et taxonomie
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Soumis le : mercredi 27 février 2019-07:58:06

Dernière modification le : mercredi 18 décembre 2024-12:24:02

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Dates et versions

hal-00614982 , version 1 (27-02-2019)

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Citer

Agnès Dettaï, Sarah J. Adamowizc, Louise Allcock, Claudia P. Arango, David K.A. Barnes, et al.. DNA barcoding and molecular systematics of the benthic and demersal organisms of the CEAMARC survey.. Polar Science, 2011, 38 (8), pp.298-312. ⟨10.1016/j.polar.2011.02.002⟩. ⟨hal-00614982⟩

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