Nous abordons dans ces travaux le problème de l'extraction de la structure physique de documents manuscrits non contraints possédant une mise en page plus ou moins complexe comme les manuscrits d'auteurs. Nous proposons une méthode de segmentation basée sur une modélisation a priori de la structure de la page. Nous avons opté pour des modèles statistiques, les champs Markoviens. Dans ce cadre, la segmentation est vue comme un problème d'étiquetage ou de décodage d'image. Nous avons appliqué ces approches à la segmentation de manuscrits d'auteurs, et nous discutons les résultats obtenus sur des manuscrits de l'écrivain Gustave FLAUBERT avec différentes méthodes de décodage.