The draft genome of <i>Ciona intestinalis</i>: Insights into Chordate and Vertebrate Origins - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Science Année : 2002

The draft genome of Ciona intestinalis: Insights into Chordate and Vertebrate Origins

Paramvir Dehal
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Résumé

The first chordates appear in the fossil record at the time of the Cambrian explosion, nearly 550 million years ago. The modern ascidian tadpole represents a plausible approximation to these ancestral chordates. To illuminate the origins of chordate and vertebrates, we generated a draft of the protein-coding portion of the genome of the most studied ascidian, Ciona intestinalis . The Ciona genome contains ∼16,000 protein-coding genes, similar to the number in other invertebrates, but only half that found in vertebrates. Vertebrate gene families are typically found in simplified form in Ciona , suggesting that ascidians contain the basic ancestral complement of genes involved in cell signaling and development. The ascidian genome has also acquired a number of lineage-specific innovations, including a group of genes engaged in cellulose metabolism that are related to those in bacteria and fungi.
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Paramvir Dehal, Yutaka Satou, Robert Campbell, Jarrod Chapman, Bernard Degnan, et al.. The draft genome of Ciona intestinalis: Insights into Chordate and Vertebrate Origins. Science, 2002, 298 (5601), pp.2157-67. ⟨10.1126/science.1080049⟩. ⟨hal-00311352⟩

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