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La collection MAGe réunit la production scientifique de l'équipe de recherche Modèles et Algorithmes pour la Génomique du laboratoire TIMC.
L'équipe MAGe créée en janvier 2022, s'inscrit dans la transformation radicale des sciences biologiques et de leur fusion avec les sciences du calcul et les mathématiques. L'équipe est interdiciplinaire, composée de biologistes et de mathématiciens maîtrisant les facettes multiples de la biologie computationelle.
Les quatre axes principaux de recherche de MAGe sont :
L'analyse des dérégulations génétiques et épigénétiques dans les cancers : caractérisation de l’hétérogénéité inter et intra-tumorale.
La génomique et épigénétique environnementale : médiation des expositions environnementales, écologie moléculaire prédictive
L'évolution des micro-organismes et métagénomique : compétition et innovation dans les communautés bactériennes
La bioinformatique des données NGS : exome-seq, rip-seq, CNVs, appel de génotypes et applications à l’infertilité masculine
Derniers dépôts
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Katia Charrière, Pierre-Ephrem Madiot, Svetlana Artemova, Pungponhavoan Tep, Christian Lenne, et al.. ODIASP: Clinically Contextualized Image Analysis Using the PREDIMED Clinical Data Warehouse, Towards a Better Diagnosis of Sarcopenia. Studies in Health Technology and Informatics, 2022, Studies in Health Technology and Informatics, 290, pp.1068-1069. ⟨10.3233/SHTI220271⟩. ⟨hal-03836846⟩
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Zeina Wehbe, Anne-Laure Barbotin, Angèle Boursier, Caroline Cazin, Jean‐pascal Hograindleur, et al.. Phenotypic continuum and poor intracytoplasmic sperm injection intracytoplasmic sperm injection prognosis in patients harboring HENMT1 variants.. Andrology, In press, Online ahead of print. ⟨10.1111/andr.13730⟩. ⟨hal-04700579⟩
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Amir Amiri-Yekta, Sharanya Sen, Florence Hazane-Puch, Célia Tebbakh, Nathalie Roux-Buisson, et al.. Whole genome sequencing identifies a homozygous splicing variant in TDRKH segregating with non-obstructive azoospermia in an Iranian family. Clinical Genetics, In press, Online ahead of print. ⟨10.1111/cge.14584⟩. ⟨hal-04633652⟩
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Zine‐eddine Kherraf, Anne‐laure Barbotin, Guillaume Martinez, Aurélien Mazet, Caroline Cazin, et al.. A splice donor variant of GAS8 induces structural disorganization of the axoneme in sperm flagella and leads to nonsyndromic male infertility. Clinical Genetics, 2023, 105 (2), pp.220-225. ⟨10.1111/cge.14450⟩. ⟨hal-04601943⟩
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