A l’issu de l’OSR-5, des bilans de matières en suspension (MES) et des contaminants particulaires associés ont été établis à l’échelle du bassin du Rhône et de ses principaux affluents. La présence de bilans déficitaires pour les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) et les éléments traces métalliques (ETM) peut être associée à des apports de contaminants le long du continuum du Rhône mais qui ne sont pas échantillonnés avec le réseau de suivi de l’OSR. Ces « sources manquantes » correspondraient à des apports diffus ou ponctuels des zones urbaines. Cette étude vise à construire une méthodologie permettant d’estimer les flux de contaminants des zones urbaines à partir de données existantes et de l’acquisition de données de terrain complémentaire. Une étude bibliographique a été menée sur les méthodologies d’évaluation des flux de contaminants d’origine urbaine et sur les indicateurs caractéristiques des rejets urbains par temps de pluie (ruissellement sur les surfaces imperméabilisées, déversoirs d’orage…). Des contaminants urbains pertinents (HAP et phtalate DEHP, ETM) ont été sélectionnés pour effectuer des analyses supplémentaires sur les MES du Rhône en amont et aval de Lyon. Des bilans de masses réalisés pour la première fois à l’échelle de l’agglomération lyonnaise sur deux années hydrologiques 2019-2021 ont permis de démontrer les apports urbains de HAP, DEHP et certains métaux au niveau de l’agglomération lyonnaise. De plus, les flux annuels de contaminants rejetés dans le Rhône et la Saône à l’échelle lyonnaise par les deux sources urbaines étudiées (déversoirs d’orage et station d’épuration) ont été calculées. Pour le mercure, ces charges sont du même ordre de grandeur que les flux annuels excédentaires en aval de Lyon. Cette étude a permis de confirmer que l’agglomération de Lyon constitue une source de contaminants non négligeable de contaminants particulaires, tels que les HAP, le DEHP et certains ETM, et susceptible de correspondre aux bilans déficitaires à l’échelle du Rhône.