Décrire les maladies localisées et la physiopathologie pour une ontologie des urgences : un algorithme générique à partir de la FMA
Abstract
OntolUrgences est une représentation termino-ontologique du domaine de la médecine d'urgence initialement développée pour la recherche d'information. Cette ressource est conçue pour assurer a) le rôle de modèle du domaine répertoriant tous les concepts pertinents et b) le lien entre les concepts et la façon dont ils sont nommé dans les documents du Dossier Patient Informatisé. Cette double fonction permet l'annotation et l'indexation de dossiers patients et assure une recherche d'informations rapide. Le développement d'\ontolurgences nous a amené à nous intéresser à l'articulation des points de vue physiologiques et anatomiques, deux composantes essentielles des modèles en médecine. Pour gérer les difficultés liées à une modélisation croisée de ces deux points de vue, très rapidement complexe et source d'erreur, il nous est apparu nécessaire d'exploiter une ressource de référence, le Foundational Model of Anatomy, la FMA, afin de réaliser une modélisation systématique de l'anatomie. Nous avons ainsi développé une méthode qui permet de générer de manière semi-automatique, à partir de la FMA : la branche des maladies localisés - e.g. maladie du tube digestif -, la branche de l'anatomie - e.g. le tube digestif lui-même -- et, enfin, la définition des axiomes de localisation - e.g. le fait qu'une maladie du tube digestif est localisée sur le tube digestif. Les premiers résultats permettent de valider la pertinence de notre démarche.
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