- Délégation à l'évaluation
- Délégation à l'Expertise scientifique collective, à la Prospective et aux Etudes
- Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture
- Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques
- Département Environnement et Agronomie
- Département Santé Animale
- Département Santé des Plantes et Environnement
- Département Sciences pour l'Action et le Développement
- Département Sciences Sociales, Agriculture et Alimentation, Espace et Environnement
- Développement et amélioration des plantes
- Direction d'appui au pilotage scientifique et de gestion
- Direction de l'Action Régionale, de l'Enseignement Supérieur et de l'Europe
- Direction de la Valorisation / Information Scientifique et Technique
- Direction de l'innovation et des systèmes d'information/information scientifique et technique DISI-IST
- Direction des Ressources Humaines et du Développement Durable
- Direction scientifique développement agricole
- Direction scientifique Environnement, Forêt et Agriculture
- DIST Délégation Information Scientifique et Technique
- Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
- Domaine expérimental d'Auzeville
- Domaine expérimental de Brunehaut
- Domaine expérimental de Melgueil
- Domaine expérimental d'Époisses - UE0115 U2E
- Domaine expérimental de Vassal
- Domaine expérimental de Versailles-Grignon
- Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural