Burkholderia genome mining for nonribosomal peptide synthetases reveals a great potential for novel siderophores and lipopeptides synthesis
Qassim Esmaeel
,
Maude Pupin
,
Nam Phuong Kieu
,
Gabrielle Chataigné
,
Max Béchet
et al.
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Critical Assessment of Metagenome Interpretation – a benchmark of computational metagenomics software
Alexander Sczyrba
,
Peter Hofmann
,
Peter Belmann
,
David Koslicki
,
Stefan Janssen
et al.
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Mise en place d'une plate-forme logicielle pour l'analyse des peptides non-ribosomiaux
Ségolène Caboche
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2009. Français.
⟨NNT : ⟩
Thèse
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Does hybridization increase evolutionary rate? Data from the 28S-rDNA D8 domain in echinoderms.
Anne Chenuil
,
Emilie Egea
,
Caroline Rocher
,
Hélène Touzet
,
Jean-Pierre Féral
et al.
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istex
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Genome Dedoubling by DCJ and Reversal
Antoine Thomas
,
Jean-Stéphane Varré
,
Ouangraoua Aïda
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Modeling Dynamic Programming Problems over Sequences and Trees with Inverse Coupled Rewrite Systems
Robert Giegerich
,
Hélène Touzet
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The molecular signal for the adaptation to cold temperature during early life on Earth
Mathieu Groussin
,
Bastien Boussau
,
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,
Samuel Blanquart
,
Manolo Gouy
et al.
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Back-translation for discovering distant protein homologies in the presence of frameshift mutations
Marta Gîrdea
,
Laurent Noé
,
Gregory Kucherov
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Non Ribosomal Peptides : A monomeric puzzle
Yoann Dufresne
,
Valérie Leclère
,
Philippe Jacques
,
Laurent Noé
,
Maude Pupin
et al.
JOBIM - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Jul 2013, Toulouse, France. pp.143-150
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Reconsidering the significance of genomic word frequencies.
Miklós Csűrös
,
Laurent Noé
,
Gregory Kucherov
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Novel components at the periphery of long read genome assembly tools
Pierre Marijon
Computer Science [cs]. University of Lille, 2019. English.
⟨NNT : ⟩
Thèse
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Kendrick Mass Defect Approach Combined to NORINE Database for Molecular Formula Assignment of Nonribosomal Peptides
Mickael Chevalier
,
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,
Emeline Hanozin
,
Maude Pupin
,
Philippe Jacques
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Compression et indexation de séquences annotées
Tatiana Rocher
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Lille, 2018. Français.
⟨NNT : ⟩
Thèse
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Data updates on Norine, the reference Non-Ribosomal Peptide knowledge base
Yoann Dufresne
,
Juraj Michalik
,
Areski Flissi
,
Valérie Leclère
,
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JOBIM 2017 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques , Jul 2017, Lille, France
Poster de conférence
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Dualities in Tree Representations
Rayan Chikhi
,
Alexander Schönhuth
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Thèse
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Christophe Vroland
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Lille 1 Sciences et technologies, 2016. Français.
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Thèse
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How to make teenage girls love coding ?
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,
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Claire Lemaitre
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,
Olivier Gascuel
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hal-00784426v1
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,
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,
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van Hoa Nguyen
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,
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COCOON 2018 - The 24th International Computing and Combinatorics Conference , Jul 2018, Qingdao, China
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Genome scaffolding with PE-contaminated mate-pair libraries
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,
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,
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Communication dans un congrès
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A new fingerprint to predict nonribosomal peptides activity.
Ammar Hasan Abdo
,
Ségolène Caboche
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,
Maude Pupin
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Nonribosomal peptide synthetase with a unique iterative-alternative-optional mechanism catalyzes amonabactin synthesis in Aeromonas
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Immunogenetics. Methods and Protocols , 2453, Springer, pp.43-59, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-2115-8.
⟨10.1007/978-1-0716-2115-8_3⟩
Chapitre d'ouvrage
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SortMeRNA: Fast and accurate filtering of ribosomal RNAs in metatranscriptomic data.
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,
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,
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