Semantic Representation of Neuroimaging Observations: Proof of Concept Based on the VASARI Terminology - E-Health Domain, IRT b<>com
Communication Dans Un Congrès Année : 2018

Semantic Representation of Neuroimaging Observations: Proof of Concept Based on the VASARI Terminology

Représentation sémantique des observations de NeuroImagerie : Preuve de concept sur la terminologie VASARI

Résumé

The main objective of this work is to facilitate the identification, sharing and reasoning about cerebral tumors observations via the formalization of their semantic meanings in order to facilitate their exploitation in both the clinical practice and research. We have focused our analysis on the VASARI terminology as a proof of concept, but we are convinced that our work can be useful in other biomedical imaging contexts. In this paper, we propose (1) a methodology, a domain ontology and an annotation tool for providing unambiguous formal definitions of neuroimaging data, (2) an experimental work on the REMBRANDT dataset to demonstrate the added value of our work over existing methods, namely DICOM SR and the AIM model.
L'objectif principal de ces travaux est de faciliter l'identification, le partage, et la réflexion autour des observations radiologiques des tumeurs cérébrales via la formalisation de leur signification sémantique afin de faciliter leur exploitation, à la fois, dans la pratique clinique et en recherche. Nous avons porté notre analyse sur la terminologie VASARI, en tant que preuve de concepts, mais nous sommes convaincus que notre travail peut être utile dans d'autres contextes de l'imagerie bio-médicale. Dans cet article, nous proposons (1) une méthodologie, une ontologie de domaine et un outil d'annotation afin de fournir des définitions formelles et non-ambigües pour des données de neuro-imagerie, (2) un travail expérimental autour du jeu de données REMBRANDT afin de démontrer la plus-value de notre travail vis-à-vis de deux autres méthodes existantes, DICOM SR et le modèle AIM.
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hal-01859199 , version 1 (21-08-2018)

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Citer

Emna Amdouni, Bernard Gibaud. Semantic Representation of Neuroimaging Observations: Proof of Concept Based on the VASARI Terminology. International Conference on Knowledge Engineering and Ontology Development, Sep 2018, Seville, Spain. pp.63-74, ⟨10.5220/0006931100630074⟩. ⟨hal-01859199⟩
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